30MU00BI - UEs facultatives - mises à niveau
30ME02BI - Initiation unix et C
Enseignant : Chroboczek J.
Responsable pédagogique : Chroboczek J.
Parcours intégrant obligatoirement cette UE : Master 1 de Biologie Informatique (pour les étudiants ne venant pas du parcours informatique ou BI) et L3 de Biologie Informatique.
Cette EC de mise à niveau comporte une initiation en Unix et C pour les étudiants venant de parcours biologie.
Résumé du programme :
Concepts fondamentaux des systèmes d'exploitation et de la compilation,
Manipulation du shell Unix et d'un éditeur de texte, Initiation à la programmation en C.
Compétences visées :
Donner aux étudiants une idée des principes de base du rôle d'un système d'exploitation, et leur donner les
moyens de manipuler un système Unix et les initier à la programmation.
A l'issue de cet enseignement, les étudiants sont à même de suivre les cours communs en Informatique.
30ME03BI - Bases Méthodologiques
Enseignants : Badel A., Guyon F.
Responsables pédagogiques : Badel A., Guyon F.
Parcours intégrant obligatoirement cette UE : Master 1 de Biologie Informatique
Cette UE de mise à niveau comporte des rappels ou des bases en méthodologie pour l'ensemble des étudiants venant de parcours biologie.
A l'issue de cet enseignement, les étudiants sont à même de suivre les cours communs de l'UE de Bioinformatique
Résumé du programme :
- Rappel de calculs matriciels
- Rappel d’analyse : fonction de plusieurs variables (1,5j)
- Rappel de Biostatistique : Théorie de l'estimation
- Rappel de Biostatistique : Théorie des tests (1j)
- Algorithme de simulation et de traitement du signal (pré requis Simulation en Biologie) (2,5j)
- Utilisation de bibliothèques GSL, algorithmes de simulations numériques et de traitement de signal.
Compétences visées :
Donner aux étudiants les méthodes de base nécessaires à la bioinformatique, et leur donner les moyens de comprendre et manipuler les outils classiques en bioinformatique.